Департамент осуществляет следующие функции:
3.1. В области охоты и сохранения охотничьих ресурсов:
3.1.1. Организация и осуществление сохранения и использования охотничьих ресурсов и среды их обитания, за исключением охотничьих ресурсов, находящихся на особо охраняемых природных территориях федерального значения.
3.1.2. Регулирование численности охотничьих ресурсов, за исключением охотничьих ресурсов, находящихся на особо охраняемых природных территориях федерального значения.
3.1.3. Ведение государственного охотхозяйственного реестра и осуществление государственного мониторинга охотничьих ресурсов и среды их обитания на территории Магаданской области, за исключением охотничьих ресурсов, находящихся на особо охраняемых природных территориях федерального значения.
3.1.4. Осуществление подготовки проекта правового акта об установлении лимитов добычи охотничьих ресурсов и квот их добычи на территории Магаданской области, за исключением таких лимитов и квот в отношении охотничьих ресурсов, находящихся на особо охраняемых природных территориях федерального значения.
3.1.5. Заключение охотхозяйственных соглашений, в том числе организация и проведение аукционов на право заключения таких соглашений.
3.1.6. Выдача разрешений на добычу охотничьих ресурсов, за исключением охотничьих ресурсов, находящихся на особо охраняемых природных территориях федерального значения, а также занесенных в Красную книгу Российской Федерации.
3.1.7. Выдача разрешений на содержание и разведение охотничьих ресурсов в полувольных условиях и искусственно созданной среде обитания (кроме охотничьих ресурсов, занесенных в Красную книгу Российской Федерации), за исключением разрешений на содержание и разведение охотничьих ресурсов, находящихся на особо охраняемых природных территориях федерального значения, в полувольных условиях и искусственно созданной среде обитания.
3.1.8. Осуществление контроля за использованием капканов и других устройств, используемых при осуществлении охоты.
3.1.9. Осуществление контроля за оборотом продукции охоты.
3.1.10. Осуществление федерального государственного охотничьего надзора на территории Магаданской области, за исключением особо охраняемых природных территорий федерального значения.
3.1.11. Выдача и аннулирование охотничьих билетов в порядке, установленном уполномоченным федеральным органом исполнительной власти.
3.1.12. Разработка и утверждение норм допустимой добычи охотничьих ресурсов, в отношении которых не устанавливается лимит добычи, и норм пропускной способности охотничьих угодий на территории Магаданской области.