Аппарат выполняет следующие основные функции;
3.1. Осуществляет организационное обеспечение реализации полномочий губернатора Магаданской области и Правительства Магаданской области.
3.2. Прорабатывает поступившие на имя губернатора Магаданской области и в Правительство Магаданской области документы и обращения федеральных органов власти, других государственных органов, в том числе субъектов Российской Федерации, Магаданской областной Думы, органов исполнительной власти области, органов (должностных лиц) местного самоуправления муниципальных образований, Совета муниципальных образований Магаданской области, предприятий и организаций различной формы собственности, граждан. Готовит по этим документам и обращениям необходимые материалы, проекты поручений губернатора Магаданской области.
3.3. Обеспечивает сбор и подготовку необходимых аналитических и справочных материалов по вопросам, рассматриваемым на заседаниях Правительства Магаданской области, Совета территории Магаданской области, других совещательных и консультативных органов при губернаторе Магаданской области и Правительстве Магаданской области, осуществляет организационное и материально-техническое обеспечение этих заседаний, подготовку совещаний и других мероприятий, проводимых с участием губернатора Магаданской области и Правительством Магаданской области, оформляет принятые решения.
3.4. Осуществляет подготовку для рассмотрения губернатором Магаданской области и Правительством Магаданской области внесенных в установленном порядке проектов постановлений и распоряжений, областных законов, договоров, соглашений, в том числе международных, и других актов.
3.5. Организует разработку законопроектов для внесения их губернатором Магаданской области в порядке законодательной инициативы в Магаданскую областную Думу.
3.6. Участвует в подготовке ежегодного Обращения губернатора к жителям Магаданской области об итогах социально-экономического развития территории и планах на ближайшую перспективу.
3.7. Обеспечивает взаимодействие с федеральными органами государственной власти, органами государственной власти Магаданской области, органами местного самоуправления, общественными объединениями, организациями различных форм собственности в целях организационного обеспечения мероприятий, проводимых губернатором Магаданской области и Правительством Магаданской области.
3.8. Обеспечивает реализацию государственной политики в области кадров и государственной службы, оказывает методическую помощь кадровым службам органов исполнительной власти области, организует дополнительное образование областных гражданских и муниципальных служащих. Ведет работу по оформлению документов к представлению граждан к государственным наградам и поощрениям от имени губернатора Магаданской области и Правительства Магаданской области и организации их вручения.
3.9. Обеспечивает реализацию государственной политики в сфере организации местного самоуправления на территории Магаданской области, взаимодействие губернатора Магаданской области и Правительства Магаданской области с органами местного самоуправления и Советом муниципальных образований Магаданской области. Оказывает необходимую организационную, правовую, методическую и практическую помощь органам местного самоуправления.
3.10. Организует ведение и учет административно-территориального устройства Магаданской области.
3.11. Обеспечивает текущее и перспективное планирование работы губернатора Магаданской области и Правительства Магаданской области, контроль за реализацией планов мероприятий.
3.12. Организует контроль за выполнением органами исполнительной власти Магаданской области решений и поручений губернатора Магаданской области, правовых актов Правительства Магаданской области, при необходимости разрабатывает предложения о принятии дополнительных мер по обеспечению выполнения этих решений и поручений.
3.13. Организует и обеспечивает ведение единой системы электронного делопроизводства, соблюдение режима секретности и служебной тайны, защиту сведений, составляющих государственную тайну, и иной, охраняемой законом информации, обеспечивает внедрение современных технических средств и информационных технологий.
3.14. Обеспечивает необходимой документацией и другими материалами губернатора Магаданской области и Правительство Магаданской области, оформляет законодательные и нормативные правовые акты, обеспечивает качество этих и других выпускаемых документов, их соответствие законодательству, организует своевременное доведение принятых решений до исполнителей, обеспечивает единую систему делопроизводства в Аппарате, принятие мер по внедрению средств вычислительной и оргтехники в организацию труда.
3.15. Рассматривает обращения граждан, письма организаций всех форм собственности, в том числе иностранных, адресованных губернатору Магаданской области и в Правительство Магаданской области, проводит с ними соответствующую информационно-аналитическую работу, подготавливает предложения по решению поставленных в них вопросов, направляет эти обращения и письма в соответствующие органы исполнительной власти области для рассмотрения и принятия мер. Организует прием граждан по личным вопросам губернатором Магаданской области и его заместителями.
3.16. Осуществляет материально-техническое и иное обеспечение структурных подразделений, входящих в Аппарат.
3.17. Обеспечивает исполнение бюджетной сметы Правительства Магаданской области, учет поступлений и использования средств внебюджетного фонда социально-экономического развития Магаданской области в условиях действия Особой экономической зоны и других денежных средств, поступающих в распоряжение Правительства Магаданской области.
3.18. Запрашивает в установленном порядке информационные и другие материалы, необходимые для деятельности Аппарата, а также в порядке контроля за выполнением нормативных правовых актов губернатора Магаданской области и Правительства Магаданской области.
3.19. Направляет в органы исполнительной власти Магаданской области, поступившие в Правительство Магаданской области документы, которые содержат вопросы, относящиеся к компетенции этих органов.
3.20. Организует освещение деятельности губернатора Магаданской области, Правительства Магаданской области в средствах массовой информации, взаимодействие губернатора Магаданской области с политическими партиями и иными общественными объединениями, действующими на территории области.
3.21. Организует работу по мобилизационной подготовке и мобилизации в исполнительных органах государственной власти Магаданской области, органах местного самоуправления и организациях. Осуществляет проведение мероприятий по мобилизационной подготовке экономики области и по переводу экономики области на работу в условиях военного времени. Разрабатывает планы перевода на работу в условиях военного времени и мобилизационного плана экономики Магаданской области. Организует руководство работой по бронированию граждан, пребывающих в запасе на период мобилизации и в военное время, за исполнительными органами государственной власти области, органами местного самоуправления и организациями.
3.22. Осуществляет организацию в Аппарате режима секретности (в том числе технической защиты информации). Методическое руководство обеспечением режима секретности в исполнительных органах государственной власти области. Координацию и контроль за обеспечением режима секретности в исполнительных органах государственной власти области, администрациях муниципальных образований. Организует работу с секретными документами и шифртелеграммами в Аппарате, по осуществлению специальной документальной связи, обеспечению ее безопасности
3.23. Аппарат выполняет иные функции в соответствии с направлениями деятельности, определенными положениями о подразделениях, решениями и поручениями губернатора Магаданской области и Правительства Магаданской области.
3.24. Осуществляет следующие функции по профилактике коррупционных и иных правонарушений:
а) обеспечивает соблюдение лицами, замещающими государственные должности Магаданской области, для которых федеральными законами не предусмотрено иное, и государственными гражданскими служащими Магаданской области запретов, ограничений и требований, установленных в целях противодействия коррупции;
б) принимает меры по выявлению и устранению причин и условий, способствующих возникновению конфликта интересов при осуществлении полномочий лицами, замещающими государственные должности Магаданской области, для которых федеральными законами не предусмотрено иное, и при исполнении должностных обязанностей государственными гражданскими служащими Магаданской области;
в) обеспечивает деятельность комиссии по соблюдению требований к служебному поведению государственных гражданских служащих Магаданской области и урегулированию конфликта интересов в Правительстве Магаданской области;