Выполнение мероприятий государственной программы осуществляется во взаимосвязи с мероприятиями ряда комплексных программ Российской Федерации и создает условия для достижения показателей социально-экономического развития Российской Федерации.
Мероприятия государственной программы оказывают влияние на реализацию мероприятий федерального проекта "Защита от наводнений и иных негативных воздействий вод и обеспечение безопасности гидротехнических сооружений". На сельских территориях проводятся мероприятия по расчистке участков русел рек и мероприятия по строительству и реконструкции сооружений инженерной защиты.
Структурные элементы государственной программы соотнесены с целями и показателями государственной программы Российской Федерации "Воспроизводство и использование природных ресурсов", утвержденной постановлением Правительства Российской Федерации от 15 апреля 2014 года N 322. В области использования водных объектов, обеспечивающих укрепление национальной безопасности Российской Федерации в рамках достижения цели "Обеспечение защищенности к 2030 году более 0,8 млн. человек, проживающих на территориях, подверженных негативному воздействию вод", планируется выполнение задач по строительству сооружений инженерной защиты, выполнению превентивных противопаводковых мероприятий, повышающих пропускную способность водотоков, обеспечению безопасности гидротехнических сооружений региональной и муниципальной форм собственности и бесхозяйных гидротехнических сооружений.