Финансирование мероприятий Программы осуществляется за счет средств федерального бюджета, республиканского бюджета, муниципальных бюджетов и внебюджетных источников.
Объем и структура бюджетного финансирования Программы приведены в формах 6 и 7 приложения 1 к Программе и подлежат ежегодному корректированию в соответствии с реальными возможностями бюджетов всех уровней и с учетом фактического выполнения программных мероприятий.
Предоставление средств федерального бюджета бюджету Карачаево-Черкесской Республики на реализацию мероприятий Программы предполагается в соответствии с Правилами предоставления субсидий бюджетам субъектов Российской Федерации на реализацию Программы (подпрограмм и мероприятий). Объемы финансирования Программы определены расчетным методом. Фактические объемы финансирования и объемы предоставления средств федерального бюджета бюджету Карачаево-Черкесской Республики будут определяться ежегодно в соответствии с соглашениями, заключаемыми Правительством Карачаево-Черкесской Республики с Министерством сельского хозяйства Российской Федерации.
Правовые основания расходных обязательств республиканского бюджета в финансовом обеспечении мероприятий Программы регулируются соответствующими порядками и правилами финансирования, утверждаемыми в установленном порядке Правительством Карачаево-Черкесской Республики.