Управление подпрограммой, механизм реализации мероприятий подпрограммы и оперативный контроль за ходом ее реализации обеспечиваются заказчиком Программы. В разделе 5 "Механизм реализации целевой Программы, включая механизмы управления целевой Программой и взаимодействие государственных заказчиков" Программы указана единая для всей Программы система организации управления и контроля за ходом выполнения Программы и её подпрограмм, включая взаимодействие государственных заказчиков.