Ответственным за реализацию Программы является государственный заказчик - Министерство здравоохранения Республики Калмыкия и Центр государственного санитарно-эпидемиологического надзора в Республике Калмыкия.
Государственный заказчик в ходе реализации Программы обеспечивает координацию деятельности основных исполнителей, контролирует своевременность выполнения мероприятий и целенаправленное использование ассигнований, формирует бюджетные заявки, предусматривая в ней ассигнования на поэтапную реализацию мероприятий Программы, и регулярно представляет ее в Министерство финансов РК для учета при формировании проектов годовых прогнозов социально-экономического развития республики.
Основные исполнители разрабатывают ежегодные этапы работы по выполнению соответствующих мероприятий, осуществляют организацию и контроль за выполнением этих мероприятий, подготавливают и направляют государственнику заказчику предложения к сводной бюджетной заявке с указанием конкретных мероприятий, необходимых ассигнований на их выполнение с подробным обоснованиями.