Механизм реализации Государственной программы базируется на принципах социального партнерства сельского населения, исполнительных органов государственной власти Республики Мордовия, органов местного самоуправления и хозяйствующих субъектов, а также четкого разграничения полномочий и ответственности всех участников Государственной программы.
Порядок предоставления субсидий за счет средств республиканского бюджета определен Правительством Республики Мордовия.
Текущее управление реализацией Государственной программы осуществляет Министерство сельского хозяйства и продовольствия Республики Мордовия, являющееся ответственным исполнителем.
Ответственный исполнитель обеспечивает согласованные действия по подготовке и реализации программных мероприятий, целевому и эффективному использованию средств республиканского бюджета, выполнению соглашений с муниципальными образованиями республики о финансировании программных мероприятий за счет средств местных бюджетов и внебюджетных источников, составляет и в установленном порядке представляет бюджетную заявку на субсидии из федерального и республиканского бюджетов для финансирования Государственной программы на очередной финансовый год, подготавливает аналитические доклады о ходе ее реализации.
В ходе выполнения Государственной программы ответственный исполнитель осуществляет взаимодействие с исполнительными органами государственной власти Республики Мордовия в рамках отдельных мероприятий Государственной программы.
Ежегодно ответственный исполнитель Государственной программы с участием заинтересованных республиканских исполнительных органов государственной власти Республики Мордовия, органов местного самоуправления республики подготавливает и до 1 марта каждого года представляет в Министерство экономики Республики Мордовия доклад о ходе реализации Государственной программы за прошедший год.