Почвы о. Сахалин разнообразны. Структура почвенного покрова представлена комбинациями равнинных и горных типов почв. Встречаются более десяти типов, которые можно объединить в следующие группы: аллювиальные, буроземы, дерново-подзолистые, подзолистые, болотные. Хорошо выражены широтная географическая зональность и вертикальная поясность.
Широтная зональность проявляется в преобладании в северной равнинно-холмистой части области подзолистых и болотно-подзолистых почв, развитых под лиственничниками; буротаежных почв под елово-пихтовыми зеленомошными лесами в центральной части острова; бурых лесных кислых почв, формирующихся под елово-пихтовыми лесами с участием широколиственных пород в юго-западной части острова.
Таким образом, в северной части Сахалина господствуют подзолистые процессы, в южной - буроземные, на увлажненных почвах развивается оглеение.
Вертикальная зональность также легко прослеживается. Верхний пояс образуют горные сухоторфянистые иллювиально-многогумусные и горно-торфянисто-глеевые почвы, развитые под зарослями кедрового стланика, выше которых местами располагается лишенная древесной растительности горная тундра с тундровыми торфянистыми почвами.
Средний пояс - лесов из каменной березы и каменноберезовых бамбуковых лесов - характеризуется преобладанием горно-лесных слабооподзоленных и неоподзоленных, иллювиально-гумусовых почв, горных буроземов.
Нижний пояс образуют горные буротаежные неоподзоленные и слабооподзоленные почвы, формирующиеся под елово-пихтовыми зеленомошными лесами, и буротаежные задернованные почвы - под вейниковыми сообществами, образовавшимися на месте зеленомошных темнохвойных лесов. Эти почвы иногда поверхностно оглеены.
Под лиственничными лишайниковыми лесами на рыхлых песчаных отложениях обычно развиты горно-подзолистые почвы. В предгорной и равнинной частях они замещаются слабо- и среднеподзолистыми почвами, а на севере острова - иллювиально-железисто-гумусными подзолами.
На склонах Западно-Сахалинских гор, обращенных в сторону Татарского пролива, древних высоких морских террасах под редкостойными вторичными лиственными лесами с примесью темнохвойных пород, с хорошо развитым травяным покровом формируются буротаежные дерново-перегнойные почвы.
Аккумулятивно-иллювиально-гумусовые и иллювиально-гумусовые буроземы формируются под курильским бамбуком и в России описаны лишь для Сахалинской области.
Надпойменные террасы и поймы рек заняты лугово-дерновыми суглинистыми и лугово-глеевыми заболоченными почвами. Для них характерно периодическое или постоянное переувлажнение и, естественно, оглеение.
Межгорные депрессии и низкие морские побережья слабо дренированы и обычно сильно заболочены. Болотные почвы Сахалина подразделяются на торфяные (верховых, переходных и низинных болот) с мощностью торфяного слоя более 3 м; торфяно-глеевые - с мощностью торфа 50 - 100 см; торфянисто-глеевые - до 50 см торфяного слоя. Характеризуются низкой зольностью.
Под ивово-тополевыми лесами - пойменные аллювиальные слоистые почвы, имеющие песчаный и супесчаный состав и, в отличие от прочих, слабокислую реакцию. Все остальные почвы - кислые и сильнокислые.
По биологической активности лесные почвы северной части Сахалина относятся к разряду слабых, а южной части - средних.
Почвы промерзают на сравнительно небольшую глубину: на севере и в средней части острова до 140 - 160 см, на юге - до 40 - 70 см. В отдельные малоснежные зимы глубина промерзания даже на юге превышает 100 см. На севере Сахалина встречаются отдельные участки многолетней мерзлоты.