Контроль качества проводится ГБУЗ ЯО "Центр контроля качества и сертификации лекарственных средств" по всем лекарственным препаратам, поставляемым в Ярославскую область в рамках государственных закупок по программам льготного лекарственного обеспечения, по лекарственным препаратам, реализуемым оптовыми и аптечными организациями на территории области. Вместе с тем ГБУЗ ЯО "Центр контроля качества и сертификации лекарственных средств" осуществляет исследования лекарственных препаратов, произведенных на территории области, с целью их декларирования.
На территории Ярославской области на базе ГБУЗ ЯО "Центр контроля качества и сертификации лекарственных средств" организован отдел мониторинга безопасности лекарственных средств. Задачами данного центра являются сбор и обработка данных о неблагоприятных побочных реакциях на лекарственные средства с последующей передачей получаемых данных в федеральный центр мониторинга безопасности лекарственных средств.
В настоящее время решен вопрос о создании в г. Ярославле филиала федеральной испытательной лаборатории по контролю качества лекарственных средств. Лаборатория является структурным подразделением федерального государственного бюджетного учреждения "Информационно-методический центр по экспертизе, учету и анализу обращения средств медицинского применения". Работа данной лаборатории значительно облегчит деятельность резидентов кластера по внедрению и производству новых терапевтических препаратов и повысит уровень контроля государства за качеством производимых лекарств.