Координацию и общий контроль осуществляет государственный заказчик - администрация Магаданской области.
Механизм реализации Программы базируется на принципах партнерства органов исполнительной власти Магаданской области, иных органов и организаций, а также четкого разграничения полномочий и ответственности всех исполнителей Программы.
Порядок реализации отдельных мероприятий Программы устанавливается постановлением администрации Магаданской области.
В ходе реализации Программы отдельные мероприятия подлежат ежегодной корректировке на основе анализа полученных результатов реализации Программы, фактической потребности в средствах на реализацию мероприятий и исходя из реальных возможностей источников финансирования Программы.