Основной целью Схемы является сохранение и поддержание восстановительного потенциала особо ценных и уникальных природных систем Алтайского края в условиях интенсивного хозяйственного освоения его территории для обеспечения устойчивого развития региона.
Для достижения данной цели предусматривается решение следующих задач:
создание условий для сохранения биологического разнообразия края, уникальных ландшафтов за счет развития и оптимизации сети ООПТ;
создание благоприятных условий для сохранения и воспроизводства наиболее ценных в хозяйственном или научном отношении естественных популяций видов растений или животных;
повышение эффективности сохранения уникальных природных, культурных объектов путем оптимизации сети ООПТ;
организация экологического просвещения населения и рекреационного использования природных ресурсов, развитие экологического и познавательного туризма с учетом вида ООПТ, функционального зонирования, социально-экономических факторов и интересов местного населения;
осуществление государственного управления в области ООПТ.