Основой экономики района является добыча топливно-энергетических полезных ископаемых (каменный уголь), производство прочих неметаллических материалов (производство щебня декоративного, облицовочных изделий из мрамора, гранита и другого природного камня), заготовка и обработка древесины, сельское хозяйство.
Основные предприятия района: ООО "Восточно-Бейский разрез", которое входит в группу компаний "СУЭК"; ОАО "МКК-Саянмрамор" и ООО "Саянмрамор-Хакасия"; ЗАО "Хакасинтерсервис".
В Бейском районе занимаются сельскохозяйственным производством 3 кооператива, 4 акционерных общества, 108 крестьянских (фермерских) хозяйств, 686 личных подсобных хозяйств.
Основной транспортный коридор района, автодорога Саяногорск - Бея - Аскиз, загружен слабо. Железнодорожная ветка Саяногорск - Кирба, ответвление от железнодорожной линии Абакан - Абаза, и тупиковая железнодорожная ветка от станции Кирба до Восточно-Бейского угольного разреза используются только для грузовых перевозок.