Реализация мероприятий Программы осуществляется на основе взаимодействия органов государственной власти Краснодарского края, органов местного самоуправления муниципальных образований Краснодарского края, хозяйствующих субъектов, а также населения Краснодарского края.
Организация управления Программой представляет собой комплекс решений отраслевого, стратегического, оперативного и территориального характера.
Схема управления Программой выглядит следующим образом:
управление реализацией Программы осуществляет глава администрации (губернатор) Краснодарского края;
общее руководство и контроль за ходом реализации Программы осуществляет министерство экономики Краснодарского края (оперативное управление, ежегодный мониторинг исполнения Программы, подготовка отчетов о ходе реализации Программы и предложений при необходимости по ее корректировке);
текущий финансовый контроль использования средств федерального и краевого бюджетов осуществляется в соответствии с установленными полномочиями органов государственной власти;
формирование нормативной правовой базы субъектами права законодательной инициативы.
Ежегодно глава администрации (губернатор) Краснодарского края направляет в Законодательное Собрание Краснодарского края отчет о ходе реализации Программы.
Необходимость корректировки Программы определяется по результатам рассмотрения ежегодных отчетов о ходе реализации Программы за истекший финансовый год.