Общий контроль за исполнением Программы осуществляет межведомственная комиссия по противодействию злоупотреблению наркотическими средствами и их незаконному обороту (далее - межведомственная комиссия), которая регулярно запрашивает у исполнителей информацию о ходе выполнения мероприятий и состоянии финансового обеспечения реализации Программы. Ежегодно на заседаниях межведомственной комиссии, губернаторском совете и в областной Думе заслушивается вопрос о ходе выполнения Программы, с отчетом руководителей структурных подразделений и ведомств - государственных заказчиков и исполнителей Программы.
При отсутствии или недостаточном финансировании Программы межведомственная комиссия вносит на рассмотрение губернатора Тульской области предложения об изменении сроков реализации Программы или снятии ее с контроля.
Финансирование мероприятий Программы осуществляет финансовое управление администрации области после принятия Закона Тульской области "Об областной целевой программе "Комплексные меры борьбы с распространением наркомании и незаконным оборотом наркотиков в Тульской области на 2001-2003 годы", в соответствии с представляемыми исполнителями сметами финансовых затрат на выполнение мероприятий.