Управление несет ответственность за:
эпизоотическое благополучие всех объектов животноводства: пушного звероводства, кролиководства, пчеловодства, рыбоводства и птицеводства, независимо от форм собственности;
своевременное планирование и проведение ветеринарно-профилактических и диагностических мероприятий организациями и учреждениями ведомственного подчинения;
доведение в установленные сроки обязательных для исполнения директивных документов вышестоящих органов (приказов, инструкций, правил, наставлений) по вопросам ветеринарии до районных, городских, поселковых, сельских государственных ветеринарных подразделений;
своевременное информирование органов исполнительной власти республики и органов местного самоуправления об эпизоотическом и ветеринарно-санитарном состоянии сельскохозяйственных и перерабатывающих предприятий и внесение необходимых предложений по профилактике и ликвидации заболеваний;
недостаточную организацию работы Управления и государственной ветеринарной службы республики по выполнению возложенных на них задач;
разглашение государственной и коммерческой тайны, сведений служебного характера, которые могут стать известны должностным лицам Управления при осуществлении ими ветеринарного надзора;
несвоевременное и недостаточное использование полномочий по предупреждению и пресечению нарушений ветеринарного законодательства Российской Федерации;
искажение государственной отчетности, сохранность документов (управленческих, финансовых, хозяйственных, по личному составу), обеспечение передачи их на государственное хранение в установленном порядке.