Программа направлена на создание условий поддержки малых предприятий. Функции государственного заказчика и координатора Программы возлагаются на Фонд поддержки малого предпринимательства Карачаево-Черкесской Республики. Для контроля и координации выполнения Программы создан экспертный совет по инвестиционной деятельности при Правительстве Карачаево-Черкесской Республики (далее - Экспертный Совет), Совет по предпринимательству при Правительстве Карачаево-Черкесской Республики (далее - Совет по предпринимательству). В состав Экспертного Совета входят представители органов исполнительной, законодательной власти Карачаево-Черкесской Республики, государственных структур республики. В состав Совета по предпринимательству входят представители органов исполнительной, законодательной власти, общественных структур и структур инфраструктуры поддержки малого предпринимательства, предприниматели Карачаево-Черкесской Республики.
На основании показателей Программы и хода выполнения предусмотренных ею мероприятий государственный заказчик ежегодно подготавливает бюджетные заявки на ассигнования из республиканского бюджета для финансирования указанной Программы и направляет их в Министерство финансов Карачаево-Черкесской Республики.
Государственный заказчик ежегодно направляет в Экспертный Совет, Народное Собрание Карачаево-Черкесской Республики отчет о состоянии и развитии малого предпринимательства и мерах по его поддержке, об использовании средств республиканского бюджета на развитие и поддержку малого предпринимательства.