1. Управление возглавляет начальник Управления, назначаемый на должность и освобождаемый от должности Президентом Карачаево-Черкесской Республики по представлению Руководителя Администрации Президента Карачаево-Черкесской Республики.
2. Начальник Управления имеет заместителя, который назначается на должность и освобождается от должности Президентом Карачаево-Черкесской Республики по представлению Руководителя Администрации Президента Карачаево-Черкесской Республики.
В период временного отсутствия начальника Управления его обязанности выполняет заместитель начальника Управления.
3. Начальник Управления:
руководит деятельностью Управления, обеспечивая решение возложенных на Управление задач;
вносит Руководителю Администрации Президента Карачаево-Черкесской Республики для представления на утверждение Президентом Карачаево-Черкесской Республики Положение об Управлении, предложения по его структуре и штатной численности;
определяет основные задачи Управления на текущий период, контролирует их исполнение;
определяет функции работников Управления;
подписывает служебную документацию в пределах своей компетенции;
вносит Руководителю Администрации Президента Карачаево-Черкесской Республики предложения о назначении на должность и освобождении от должности работников Управления;
вносит Руководителю Администрации Президента Карачаево-Черкесской Республики предложения о поощрении работников Управления и применении к ним мер дисциплинарного воздействия.