Объектами, подлежащими региональному государственному контролю и надзору за использованием и охраной водных объектов на территории Карачаево-Черкесской Республики, являются объекты хозяйственной и иной деятельности, осуществляемой физическими и юридическими лицами и связанной с использованием и охраной водных объектов, а также использованием территорий водоохранных зон и прибрежных защитных полос следующих водных объектов:
1. Поверхностных водных объектов, полностью расположенных на территории Карачаево-Черкесской Республики и не относящихся к объектам, подлежащим федеральному государственному контролю и надзору за использованием и охраной водных объектов.
2. Водных объектов или их частей, используемых для нужд городов с численностью населения менее ста тысяч человек, а также для нужд предприятий и иных организаций, производящих забор воды или сброс сточных вод в объеме не более 15 млн. куб. метров в год, и не относящихся к объектам, подлежащим федеральному государственному контролю и надзору за использованием и охраной водных объектов.
3. Особо охраняемых водных объектов, либо водных объектов, являющихся особо охраняемыми природными территориями регионального значения или представляющих собой часть этих территорий и не относящихся к объектам, подлежащим федеральному государственному контролю и надзору за использованием и охраной водных объектов.