Управление реализацией Программы осуществляется Министерством здравоохранения Республики Ингушетия.
Министерство здравоохранения Республики Ингушетия, Министерство сельского хозяйства и продовольствия Республики Ингушетия, Министерство внутренних дел Республики Ингушетия ежегодно в установленном порядке направляют информацию о ходе реализации Программы и эффективности использования финансовых средств в Министерство экономики и Министерство финансов Республики Ингушетия.