Организация выполнения Программы возлагается на Государственного заказчика. По отдельным направлениям Программы Государственным заказчиком разрабатываются конкретные планы действий и мероприятий, заключаются договоры и соглашения.
Государственный заказчик осуществляет конкурсный отбор исполнителей проектов (подрядчиков работ), финансируемых из средств бюджета Республики Ингушетия, разрабатывает и контролирует график организационно-технических мероприятий, ведет приемку выполненных работ, представляет Президенту и Председателю Правительства Республики Ингушетия отчеты по результатам выполнения мероприятий Программы.