Управление реализацией Программы осуществляется Министерством внутренних дел Республики Адыгея.
Межведомственная комиссия Республики Адыгея по противодействию злоупотреблению наркотическими средствами и их незаконному обороту осуществляет контроль за ее выполнением. Ежегодно на заседаниях коллегий Министерства здравоохранения Республики Адыгея и Министерства внутренних дел Республики Адыгея рассматриваются вопросы о ходе и эффективности использования финансовых средств. Информация и доклады о ходе выполнения Программы и об использовании средств республиканского бюджета Республики Адыгея готовятся в установленном порядке.