Основные права руководителя исполнительного органа государственной власти Санкт-Петербурга определены в статье 14 Федерального закона "О государственной гражданской службе Российской Федерации".
В целях исполнения должностных обязанностей руководитель исполнительного органа государственной власти Санкт-Петербурга вправе:
издавать приказы и распоряжения;
подписывать и визировать документы;
представлять исполнительный орган государственной власти Санкт-Петербурга в иных государственных органах, органах местного самоуправления, общественных объединениях и других организациях;
давать указания;
принимать управленческие и иные решения в соответствии с должностными обязанностями;
вносить предложения о совершенствовании деятельности исполнительного органа государственной власти Санкт-Петербурга;
запрашивать и получать в установленном порядке информацию и материалы, необходимые для исполнения должностных обязанностей;
делегировать предоставленные ему полномочия подчиненным должностным лицам;
осуществлять иные права, предусмотренные Положением об исполнительном органе государственной власти Санкт-Петербурга.