2.1. Основными задачами Департамента являются:
2.1.1. Участие в осуществлении функций Министерства по выработке государственной политики и нормативному правовому регулированию в сфере транспорта по вопросам, отнесенным к компетенции Департамента.
2.1.2. Реализация с участием структурных подразделений Министерства полномочий Министерства как ответственного исполнителя государственной программы Российской Федерации "Развитие транспортной системы".
2.1.3. Организация и осуществление совместно со структурными подразделениями Министерства, службой и агентствами деятельности по формированию и корректировке федеральных целевых программ по развитию транспортной инфраструктуры, в реализации которых участвует Министерство, служба и агентства.
2.1.4. Участие в формировании инвестиционной политики в сфере транспорта.
2.1.5. Организация и осуществление совместно со структурными подразделениями Министерства, агентствами деятельности по реализации инфраструктурных проектов на основе государственно-частного партнерства в сфере транспорта.
2.1.6. Организация и осуществление разработки совместно со структурными подразделениями Министерства, службой и агентствами прогнозов социально-экономического развития транспортного комплекса на среднесрочную и долгосрочную перспективу.
2.1.7. Организация и проведение совместно со структурными подразделениями Министерства, службой и агентствами анализа социально-экономического развития транспортного комплекса и мониторинга основных показателей его деятельности.
2.1.8. Организация и координация в установленном порядке деятельности по совершенствованию статистического наблюдения в сфере транспорта.
2.1.9. Реализация функции Министерства по утверждению планов показателей деятельности службы и агентств.
2.1.10. Реализация с участием структурных подразделений Министерства, службы и агентств полномочий Министерства как субъекта бюджетного планирования.
2.1.11. Реализация полномочий Министерства по осуществлению функций главного распорядителя и получателя средств федерального бюджета, предусмотренных на содержание Министерства и выполнение возложенных на Министерство функций.
2.1.12. Организация плановых проверок деятельности службы и агентств, организаций, находящихся в ведении Министерства, а также проверок соблюдения получателями межбюджетных трансфертов, имеющих целевое назначение, а также субсидий и бюджетных инвестиций, условий, целей и порядка, установленных при их предоставлении.
2.1.13. Осуществление внутреннего финансового контроля внутренних процедур составления и исполнения бюджета, ведения бюджетного учета и составления бюджетной отчетности (внутренних бюджетных процедур).
2.1.14. Осуществление внутреннего финансового аудита.
2.1.15. Организация и ведение бухгалтерского учета в Министерстве, а также составление. и представление бухгалтерской отчетности и сводной бюджетной отчетности федеральных бюджетных и автономных учреждений, подведомственных Министерству, в соответствии с законодательством Российской Федерации.