3.1. В соответствии с возложенными основными задачами Департамент осуществляет следующие функции:
3.1.1. Разрабатывает предложения по совершенствованию системы управления в области морского и внутреннего водного транспорта.
3.1.2. Участвует в реализации Морской доктрины Российской Федерации на период до 2020 года.
3.1.3. Разрабатывает предложения по оптимальному использованию морских и внутренних водных путей, включая Северный морской путь, в рамках единой российской транспортной системы.
3.1.4. Разрабатывает предложения по формированию государственной инвестиционной политики в области морского и внутреннего водного транспорта.
3.1.5. Разрабатывает предложения по совершенствованию государственной антимонопольной политики на морском и внутреннем водном транспорте.
3.1.6. Вырабатывает и реализует техническую и научно-техническую политику на морском и внутреннем водном транспорте.
3.1.7. Участвует в выработке государственной инновационной политики на морском и внутреннем водном транспорте.
3.1.8. Участвует в подготовке предложений по управлению федеральным имуществом в области морского и внутреннего водного транспорта.
3.1.9. Участвует в подготовке предложений по реализации требований Киотского протокола.
3.1.10. Участвует в работе по выработке предложений в области транспортной безопасности по вопросам морского и внутреннего водного транспорта.
3.1.11. Обеспечивает разработку, анализ применения и внесение изменений в законодательные акты и нормативные правовые акты Президента Российской Федерации и Правительства Российской Федерации в области морского и внутреннего водного транспорта.
3.1.12. Разрабатывает предложения в Правительство Российской Федерации по установлению границ акваторий и территорий морских портов, а также по перечню портов, в которых разрешается заход судов, в том числе под иностранным флагом, и иных плавучих средств с ядерными установками и радиационными источниками.
3.1.13. Участвует в подготовке для внесения в Правительство Российской Федерации предложений о присвоении наименований морским и речным портам и переименовании морских и речных портов.
3.1.14. Участвует в разработке проектов технических регламентов.
3.1.15. Готовит к внесению в Правительство Российской Федерации проекты федеральных законов, нормативных правовых актов Президента Российской Федерации и Правительства Российской Федерации и другие документы, по которым требуется решение Правительства Российской Федерации в части вопросов, отнесенных к компетенции Департамента.
3.1.16. Осуществляет разработку, анализ применения и внесение изменений в нормативные правовые акты в области морского и внутреннего водного транспорта, в том числе:
правила перевозок пассажиров, багажа, груза, грузобагажа на основании и во исполнение транспортных уставов и кодексов в сфере морского и внутреннего водного транспорта;
положение о расследовании аварий или инцидентов на море по согласованию с Федеральным агентством по рыболовству и Министерством обороны Российской Федерации;
положение о расследовании транспортных происшествий на внутреннем водном транспорте;
правила содержания внутренних водных путей;
правила содержания судоходных гидротехнических сооружений;
акты, определяющие бассейны внутренних водных путей;
порядок добычи нерудных строительных материалов на внутренних водных путях;
правила учета бесхозяйных судов;
положение об аттестации капитанов судов внутреннего плавания;
правила плавания судов по внутренним водным путям;
правила движения и стоянки судов в бассейнах внутренних водных путей;