С целью решения стоящих перед Комиссией задач в ее состав входят следующие постоянные рабочие группы:
а) по торгово-экономическому сотрудничеству и приоритетным проектам;
б) по сотрудничеству в области промышленности;
в) по сотрудничеству в банковско-финансовой сфере;
г) по сотрудничеству в области транспорта;
д) по сотрудничеству в области энергетики;
е) по сотрудничеству в области геологии и горной промышленности;
ж) по сотрудничеству в области здравоохранения;
з) по сотрудничеству в области информационных технологий и связи;
и) по сотрудничеству в области образования;
к) по сотрудничеству в области науки, технологии и окружающей среды;
л) по сотрудничеству в области сельского хозяйства;
м) по сотрудничеству в области культуры, туризма и спорта;
н) по сотрудничеству в области таможенного дела;
о) по военно-техническому сотрудничеству.