АПК Российской Федерации охватывает отрасли по производству сельскохозяйственного сырья, его хранению, переработке, производству продукции пищевого и непищевого назначения: растениеводство, животноводство, кормопроизводство, перерабатывающую и пищевую промышленность. Смежными с АПК отраслями являются производство сельскохозяйственной техники, безопасное и эффективное использование удобрений и агрохимикатов, а также рыбохозяйственный комплекс.
Полномочия Минсельхоза России в соответствии с действующим Положением о Министерстве распространяются на сельское хозяйство и пищевую промышленность, а также на рыбохозяйственный комплекс. Отдельные смежные отрасли, имеющие системное значение для развития АПК, не входят в состав полномочий Министерства, что предполагает межведомственную координацию деятельности с Минпромторгом России, Минэнерго России, Минприроды России и рядом других федеральных органов исполнительной власти, а также в части научно-технологического развития и образовательной деятельности - Минобрнауки России.