Доверенные третьи стороны организуются на уровне каждого государства-члена, а также в Комиссии. С технической точки зрения взаимосвязанная инфраструктура доверенных третьих сторон (программно-аппаратные комплексы) должна быть размещена во всех национальных сегментах и интеграционном сегменте интегрированной системы. Территориальное размещение комплексов доверенных третьих сторон необходимо с точки зрения обеспечения соответствия законодательным ограничениям на экспорт криптографических технологий в каждом из государств - членов.
Доверенные третьи стороны оказывают участникам межгосударственного информационного обмена услуги по проверке ЭЦП отправителя в криптографическом стандарте юрисдикции отправителя с подписанием квитанции как результата такой проверки. Электронный документ с результатом положительной проверки доверенной третьей стороной признается в юрисдикции получателя равнозначным электронному документу, подписанному собственной ЭЦП отправителя на основе нормы о признании ЭЦП, выданной в соответствии с законодательством другого государства.
При построении службы доверенной третьей стороны интегрированной системы необходимо создание юридических условий и договорных связей, соответствующих законодательству государств - членов (в части признания ЭЦП, созданной в другом государстве), а также функциональным особенностям интегрированной системы и порядку предполагаемого взаимодействия.
Создание системы юридических условий и договорных связей предполагает разработку и принятие нормативных актов и договоров между участниками информационного обмена.