Основными задачами отдела являются:
2.1. Организационно-техническое, правовое, информационное, документационное обеспечение деятельности комиссии по вопросам помилования на территории Вологодской области.
2.2. Подготовка поступивших из Управления Министерства юстиции Российской Федерации по Вологодской области материалов по ходатайствам о помиловании осужденных, отбывающих наказание на территории Вологодской области, для рассмотрения их на комиссии по вопросам помилования на территории Вологодской области (далее именуется - комиссия).
2.3. Подготовка для рассмотрения на комиссии материалов по ходатайствам граждан, отбывших назначенное судом наказание и имеющих не погашенную и не снятую судимость, проживающих на территории Вологодской области о помиловании в виде снятия судимости, направленных заявителями самостоятельно в комиссию по вопросам помилования.