Государственным заказчиком подпрограммы является Министерство сельского хозяйства Карачаево-Черкесской Республики. В части оказания мер государственной поддержки Министерство сельского хозяйства Карачаево-Черкесской Республики является исполнителем мероприятий подпрограммы.
Реализация программных мероприятий обеспечивается на основе государственных контрактов (договоров), заключаемых с исполнителями, определяемыми на конкурсной основе: государственными водохозяйственными и агрохимическими предприятиями, лесхозами, учреждениями и различными акционерными и другими организациями, привлекаемыми в качестве подрядчиков.
Часть работ может быть выполнена непосредственно землепользователями.
Непосредственная реализация мероприятий подпрограммы землепользователями осуществляется на основе утвержденных проектов землеустройства, содержащих мероприятия по рациональному использованию и охране земель, разрабатываемых проектно-изыскательскими организациями по землеустройству, имеющими лицензии на проведение этих мероприятий.