Общий объем финансирования Программы в 2013-2017 годах составит 40446 тыс. рублей.
Основными источниками финансирования Программы являются:
средства федерального бюджета, предоставляемые на конкурсной основе в форме субсидий бюджету Карачаево-Черкесской Республики на софинансирование мероприятий Программы;
средства республиканского бюджета;
средства местных бюджетов (по согласованию);
средства кредитных и других организаций, предоставляющих молодым учёным кредиты и займы на приобретение жилого помещения или строительство индивидуального жилого дома, в том числе ипотечные жилищные кредиты;
средства молодых учёных, используемые для частичной оплаты стоимости приобретаемого жилого помещения или строительства индивидуального жилого дома.
Объемы финансирования Программы (2013-2017 годы) приведены в приложении 2 к Программе.