4.1. Контрольное управление возглавляет начальник, назначаемый на должность и освобождаемый от должности Губернатором города Севастополя в установленном порядке.
4.2. В период временного отсутствия начальника Контрольного управления (в связи с болезнью, командировкой и по другим причинам) его обязанности исполняет заместитель начальника Контрольного управления.
4.3. Начальник Контрольного управления:
4.3.1. Организует работу Контрольного управления и контролирует его деятельность.
4.3.2. Осуществляет планирование деятельности Контрольного управления.
4.3.3. Представляет на утверждение Правительства Севастополя структуру и штатное расписание Контрольного управления в пределах утвержденной предельной численности Контрольного управления и фонда оплаты труда.
4.3.4. Утверждает положения о структурных подразделениях Контрольного управления.
4.3.5. Утверждает должностные регламенты государственных гражданских служащих города Севастополя, проходящих службу в Контрольном управлении.
4.3.6. Отчитывается перед Губернатором города Севастополя и Правительством Севастополя по результатам деятельности Контрольного управления.
4.3.7. Осуществляет в установленном порядке расходование денежных средств в пределах выделенных ассигнований, обеспечивает соблюдение финансовой дисциплины и повышение эффективности использования средств бюджета города Севастополя, предусмотренных на содержание Контрольного управления и реализацию возложенных на него полномочий.
4.3.8. Подписывает в пределах своей компетенции правовые акты (приказы, распоряжения) Контрольного управления, осуществляет контроль за их исполнением.
4.3.9. Обеспечивает эффективное использование и сохранность имущества города Севастополя, закрепленного за Контрольным управлением.
4.3.10. Действует без доверенности от имени Контрольного управления, заключает от имени Контрольного управления договоры (контракты) и соглашения, совершает иные юридические действия.
4.3.11. Представляет Контрольное управление в федеральных органах государственной власти, иных государственных органах, органах местного самоуправления, в организациях, общественных объединениях граждан.