Деятельность Правительства Новгородской области осуществляется в соответствии со следующими принципами:
1) государственная и территориальная целостность Российской Федерации;
2) распространение суверенитета Российской Федерации на всю ее территорию;
3) верховенство Конституции Российской Федерации, федеральных конституционных законов и федеральных законов на всей территории Российской Федерации;
4) единство системы государственной власти;
5) разделение государственной власти на законодательную, исполнительную и судебную в целях обеспечения сбалансированности полномочий и исключения сосредоточения всех полномочий или большей их части в ведении одного органа государственной власти либо должностного лица;
6) разграничение предметов ведения и полномочий между органами государственной власти Российской Федерации и органами государственной власти Новгородской области;
7) самостоятельное осуществление органами государственной власти Новгородской области принадлежащих им полномочий;
8) самостоятельное осуществление своих полномочий органами местного самоуправления.