Технологическая схема предназначена для очистки подземной воды только от железа и мутности, принята без учета физико-химического качества подземной воды (растворенные газы, марганец, комплексные органические соединения железа и марганца, аммиак, кремний и т.д.) и антропогенного воздействия на природные источники, что приводит к появлению в воде различных химических загрязнителей. Кроме того, с введением СанПиН 2.1.4.1074-01 "Питьевая вода. Гигиенические требования к качеству воды централизованных систем питьевого водоснабжения. Контроль качества. Гигиенические требования к обеспечению безопасности систем горячего водоснабжения" произошло ужесточение нормативных значений показателей, предъявляемых к качеству очищенной воды, введены новые нормируемые показатели, что, естественно, не предусмотрено проектом.
Очищенная вода с 1-й и 2-й очереди поступает в резервуары чистой воды, откуда забирается НС 2-го подъема и по двум водоводам Ду1000 мм подается в разводящие сети города. Обеззараживание производится путем подачи хлорной воды в трубопровод перед насосами 2-го подъема (дозой 1,5 - 3 мг/л).
Промывка скорых фильтров осуществляется забором очищенной воды из РЧВ и подачей ее промывными насосами (1 раб./1 рез.) в коллектор промывной воды, общий для 1-й и 2-й очереди станции обезжелезивания, а затем к промываемым сооружениям. После промывки фильтров, промывная вода отводится на рельеф.
В 2007 году реконструирована 2-я очередь станции обезжелезивания.
В 2010 году реконструирована 1-я очередь станции обезжелезивания.
В 2011 году реализована модернизация сборных водоводов;
В 2012 году была произведена замена приводов к затворам на НС 2-го подъема Велижанского водозабора, а также устройство частотного регулирования на насосном оборудовании.
В очищенной воде Велижанского водозабора наблюдается превышение ПДК по показателям:
цветность;
марганец;
остаточный хлор;
аммиак и ионы аммония;
кремний.