Мероприятия программы реализуются в рамках следующих подпрограмм:
1) "Обеспечение экологической безопасности";
2) "Развитие лесного хозяйства";
3) "Развитие водохозяйственного комплекса";
4) "Повышение эффективности управления и распоряжения земельными ресурсами и государственным имуществом Республики Алтай";
5) "Обращение с отходами производства и потребления, в том числе с твердыми коммунальными отходами, в Республике Алтай".
(п. 5 введен Постановлением Правительства Республики Алтай от 28.12.2017 N 376)