Координатором БТИ является Правительство Республики Башкортостан, которое формирует и реализует на практике государственную научно-техническую и инновационную политику в регионе, в том числе в рамках Стратегии социально-экономического развития Республики Башкортостан и государственной программы "Развитие науки и технологий".
Стратегические программы развития Республики Башкортостан определяют в пределах горизонтов прогнозирования приоритетные отрасли экономики региона, на основе мониторинга которых ежегодно формируется перечень приоритетных направлений фундаментальных и прикладных научных исследований, утверждаемый Правительством Республики Башкортостан.
Реализацию БТИ осуществляет АН РБ в период с 2018 по 2023 год с последующей корректировкой целевых индикаторов.
Приоритетные отрасли применения БТИ коррелируются с Национальной технологической инициативой (таблица 1).