3.1. Комиссию возглавляет председатель (в его отсутствие - заместитель председателя).
3.2. Председатель руководит деятельностью комиссии, утверждает план ее работы, ведет заседания, информирует Губернатора Алтайского края о результатах работы комиссии, а также несет персональную ответственность за выполнение возложенных на комиссию задач.
3.3. Члены комиссии лично участвуют в рассмотрении вопросов (в случае болезни члена комиссии, а также по иным уважительным причинам в работе комиссии по согласованию с председателем может участвовать лицо, замещающее члена комиссии).
3.4. Заседания комиссии проводятся по мере необходимости, но не реже одного раза в полугодие, и считаются правомочными, если на них присутствуют более половины членов комиссии (лиц, их замещающих). Дата проведения и повестка дня заседания комиссии утверждаются председателем комиссии или его заместителем.
3.5. Комиссия принимает решения путем проведения открытого голосования простым большинством голосов присутствующих на заседании. При равенстве голосов решающим является голос председательствующего на заседании.
3.6. На заседании ведется протокол, который подписывается председательствующим и секретарем комиссии.
3.7. Организация и ведение делопроизводства комиссии, обеспечение сохранности материалов и их подготовка к сдаче в архив, подготовка сводного доклада председателю комиссии об исполнении поручений, данных по результатам заседаний, по форме и с периодичностью, установленной председателем, осуществляется секретарем комиссии.
3.8. Организационное обеспечение деятельности комиссии осуществляется Министерством природных ресурсов и экологии Алтайского края.