Направление селекционно-племенной работы в продуктивном коневодстве республики - проведение системы зоотехнических мероприятий, направленных на повышение продуктивных, воспроизводительных и приспособительных качеств пород, внутрипородных типов лошадей, сохранение, совершенствование, и в ряде случаев, создание новых, высокопродуктивных линий выдающихся жеребцов-производителей.
Важное направление селекционно-племенной работы в конных заводах - создание заводских типов табунных лошадей с высокими продуктивными качествами для заметного повышения продуктивных качеств контингента лошадей в товарных коневодческих хозяйствах.
Породы лошадей состоят из структурных единиц - линий и семейств. Постоянство генетической структуры пород в конных заводах обеспечивается разведением не менее 5 - 6 высокопродуктивных линий выдающихся жеребцов-производителей и закреплением в их потомстве ценных особенностей лучших лошадей породы для получения молодняка с устойчивой наследственностью. Последующее широкое размножение в племенных репродукторах элитных линейных жеребчиков обеспечивает быстрейшее повышение качества всего массива породы, росту продуктивности лошадей товарных хозяйств.
В племенном коневодстве с переходом на реализацию молодняка в 6-месячном возрасте, в повседневной практике ведения племенного дела произошел отход от возможностей метода отбора. С учетом того, что за жеребцами кобылы закрепляются на весь период воспроизводящего цикла, отсутствует возможность применения метода подбора. Не проводится выращивание племенного молодняка до 2,5 - 3 лет и его бонитировка и отбор. Поэтому слабо выполняется главная задача конных заводов и племенных репродукторов - линейное разведение молодых жеребцов - продолжателей линий выдающихся жеребцов-производителей - основателей линий, оценка жеребцов-производителей по качеству потомства.
В настоящее время проводится реализация племенных животных в возрасте 6-месяцев, в основном кобылками. Поэтому практически не действует система широкого размножения высокопродуктивных линейных жеребчиков в племенных репродукторах. Сложилось положение, когда конные заводы не заинтересованы в доращивании потомства линейных жеребцов-производителей до 2,5 - 3 лет, в их бонитировке, передаче их в племенные репродукторы и, как следствие, в племенные репродукторы вынужденно не выполняют возложенных на них обязанностей широкого размножения животных высокопродуктивных линий и обеспечения ими товарные хозяйства.