Миксоспоридиозы - вызываются паразитическими простейшими, относящимися к типу Microsporidia. Болеют сиговые, карповые рыбы, щука и окунь. Зараженность омуля составляет 33%, ряпушки - 25%, золотого карася - 22,4%, гольяна озерного - 10,5% и сибирской плотвы - 2%. Миксоспоридии у омуля представлены видами Henneguya zschokei, Chloromyxum coregoni у карасей Myxobolus carassi и M. mulleri, у озерного гольяна M. musculi.
Лечение не разработано.
Лигулез и диграммоз. Заболевания рыб, вызываемые личинками (плероцеркоидами) ремнецов Ligulainestinalisи Digrammainterrupta. Личинки паразитируют в брюшной полости рыб в виде крупных лентовидных гельминтов бело-серого цвета.
Возбудители лигулидозов рыб для человека и плотоядных животных не представляют опасность. Рыбу, пораженную личинками гельминтов, если она соответствует требованиям товарной кондиции, допускают в пищу людям через сеть общественного питания. Однако в торговую сеть пораженную рыбу допускают только в потрошеном виде (после удаления личинок гельминтов).
Профилактические мероприятия. В совокупности система мероприятий по профилактике заболевания в основном сводится к трем взаимосвязанным разделам: эпизоотическому анализу, санитарному вылову и биологическому методу профилактики.
Эпизоотический анализ показал, что у рыб Вилюйского водохранилища паразитирует 1 вид ремнецов рода Ligula - L. intestinalis. Возраст рыбы больной лигулезом составляет 1 - 8 лет. Основная масса больной рыбы представлена особями в возрасте 3 - 4 лет. У рыб в возрасте 2 - 3 лет гибель от лигулеза бывает массовой. Стойкие очаги лигулеза регистрируются в двух разливах водохранилища Чонском (56,7%) и Кусаганском (68%). Установлено, что наиболее сильно плотва заражена в прибрежной части водохранилища, на мелководье (57%) и в меньшей степени (21%) на удаленных участках.
Санитарный вылов. После проведения эпизоотического анализа, с помощью контрольных обловов выявляют места концентрации больных рыб и организуют санитарный вылов. С третьей декады мая по вторую декаду июня организуют массовый вылов рыбы ставным неводом (вентерем), из расчета 1 вентерь на 1 участок мелководий разлива водохранилища. Использовать для санитарного вылова закидные невода невозможно из-за изобилия затопленных деревьев. Больная рыба, перемещаясь вдоль берега в поисках пищи, встречает на своем пути центральное крыло вентеря, двигаясь вдоль крыла, попадает в ловушку.
С целью недопущения большого скопления рыбоядных птиц вся извлеченная больная рыба, а так же отходы переработки других видов рыб утилизируются.
Биологический метод профилактики лигулеза рыб. Сущность мероприятия сводится к целенаправленному управлению структурой биоценоза водоема с целью обогащения его наиболее эффективными элиминаторами инвазионного материала. В первой половине июня осуществляется зарыбление, неблагополучных по лигулезу, заливов невосприимчивыми к заболеванию рыбами - личинками пеляди в количестве от 200 тысяч штук на залив.
Триэнофороз. Заболевания многих видов рыб вызываемые паразитированием взрослых ленточных гельминтов и их личинок вида Triaenophorus nodulosus. Ущерб складывается из потерь массы тела. Половозрелой стадией лентецов поражаются щука 25%, налим 58%, личиночной стадией сиговые и карповые рыбы.