Финансирование государственной программы осуществляется за счет средств федерального бюджета, средств краевого бюджета, средств Федерального фонда обязательного медицинского страхования, средств Территориального фонда обязательного медицинского страхования Алтайского края.
Общий объем финансирования программы составляет 230854805,1 тыс. рублей, в том числе по годам:
2014 год - 26230612,7 тыс. рублей;
2015 год - 28573729,2 тыс. рублей;
2016 год - 28715461,1 тыс. рублей;
2017 год - 32592047,5 тыс. рублей;
2018 год - 38462018,6 тыс. рублей;
2019 год - 37896134,3 тыс. рублей;
2020 год - 38384801,7 тыс. рублей.
Средства федерального бюджета - 18920516,7 тыс. рублей, в том числе по годам:
2014 год - 2306404,4 тыс. рублей;
2015 год - 2572115,7 тыс. рублей;
2016 год - 2575022,3 тыс. рублей;
2017 год - 2232249,8 тыс. рублей;