Основными задачами Межведомственной комиссии являются:
2.1. Достижение устойчивой положительной динамики развития налоговой базы в Республике Башкортостан.
2.2. Определение резервов увеличения поступлений в бюджеты Республики Башкортостан и муниципальных образований, оценка факторов роста налоговых и неналоговых доходов.
2.3. Повышение эффективности использования государственного имущества Республики Башкортостан и муниципального имущества.
2.4. Разработка предложений по совершенствованию законодательства о налогах и сборах, в том числе по вопросам установления региональных и местных налогов.
2.5. Обеспечение полноты и своевременности платежей и погашения задолженности в консолидированный бюджет Республики Башкортостан.
2.6. Повышение уровня налоговой культуры и налоговой грамотности физических и юридических лиц на территории Республики Башкортостан, содействие распространению лучших практик в сфере налогообложения в Республике Башкортостан.
2.7. Популяризация добросовестного отношения налогоплательщиков к выполнению своих налоговых обязательств.