Финансирование программы осуществляется из нескольких источников.
Из государственного бюджета РС(Я) финансирование осуществляется в рамках субсидий на проведение противопожарных, антитеррористических мероприятий, оснащение медицинских кабинетов, в рамках Комплексного проекта модернизации общего образования в 2011 - 2013 годах, Инвестиционной программы Республики Саха (Якутия), Государственной программы развития образования РС(Я) на 2012 - 2016 годы, Государственной программы РС(Я) "Безбарьерная среда на 2012 - 2016 годы", Государственной программы РС(Я) "Сохранение, изучение и развитие государственных и официальных языков в РС(Я) на 2012 - 2016 годы". Объем финансирования из республиканского бюджета определяется ежегодно при условии софинансирования из бюджета городского округа "город Якутск". Формы поддержки предусматривают как выделение финансовых средств, так и выделение оборудования, мебели, транспорта и пр. Также планируется привлечь дополнительное финансирование в рамках общереспубликанского движения добрых дел "Моя Якутия в XXI веке". В 2015 - 2016 годах по отрасли "Образование" за счет средств государственного бюджета Республики Саха (Якутия) выделяются средства для создания доступной безбарьерной среды. В 2015 году выделено 4 269,51 тыс. руб., приобретено и установлено оборудование в МОБУ ДОД ДДТ, МОБУ ДОД Д(П)Ц, МБДОУ Д/с N 1 "Звездочка". В 2016 году выделено 2 970,0 тыс. руб., приобретено и установлено оборудование в МБУ ДОД Д(П)Ц, МБУ ДО ДДТ, МБДОУ ЦРР-Д/с N 11 "Подснежник". В целях повышения доступности объектов образования для маломобильных групп населения в 2016 году за счет средств бюджета городского округа "город Якутск" установлены пандусы в МОБУ Мархинская СОШ N 1, МОБУ Маганской СОШ, МОБУ Хатасской СОШ им. П.Н. и Н.Е. Самсоновых, МБДОУ ЦРР-Д/с N 11 "Подснежник".
В рамках исполнения полномочий по финансовому обеспечению образовательного процесса, отнесенного к полномочиям органов государственной власти субъектов Российской Федерации, осуществляется финансирование из республиканского бюджета в виде субвенции на реализацию общего стандарта образования, на содержание образовательных специальных (коррекционных) учреждений, на содержание образовательных учреждений для детей-сирот и детей, оставшихся без попечения родителей, на реализацию стандарта дошкольного образования, на выплату компенсации части родительской платы за содержание ребенка в дошкольных образовательных учреждениях, субсидии на организацию оздоровительных и других мероприятий для детей и молодежи, на предоставление льгот на коммунальные услуги педагогическим работникам, на предоставление учителям общеобразовательных учреждений ипотечного кредита.
Федеральная поддержка осуществляется в рамках субсидий из федерального бюджета бюджетам субъектов РФ на модернизацию региональных систем общего образования, федеральных субсидий на проведение капитального строительства, приобретение и реконструкцию зданий дошкольных образовательных учреждений.