Исполнение бюджета города Махачкалы обеспечивается Администрацией города.
Организация исполнения бюджета города Махачкалы возлагается на Финансовое управление. Исполнение бюджета города Махачкалы организуется на основе сводной бюджетной росписи и кассового плана.
Бюджет города Махачкалы исполняется на основе единства кассы и подведомственности расходов.
Кассовое обслуживание исполнения бюджета осуществляется Федеральным казначейством.