В 1999 г. на территории области была создана Особая экономическая зона, в соответствие с Федеральным законом N 104-ФЗ "Об Особой экономической зоне в Магаданской области". Особая экономическая зона - территория, расположенная в административных границах города Магадана, на которой установлен особый правовой режим хозяйственной деятельности для субъектов хозяйственной деятельности, имеющих статус участников Особой экономической зоны, что подтверждается регистрационным свидетельством. Особый правовой режим хозяйственной деятельности заключается в особом налоговом и таможенном режиме.
Установленным налоговым режимом предусмотрено, что в период с 1 января 2007 г. по 31 декабря 2014 г. участники Особой экономической зоны освобождаются от уплаты налога на прибыль, инвестируемую в развитие производства и социальной сферы на территории области. Особый таможенный режим заключается в том, что иностранные товары, приобретаемые участниками Особой экономической зоны для собственных производственных нужд и используемые на территории области, при ввозе с территории Особой экономической зоны на остальную территорию области, освобождаются от ввозных таможенных пошлин и других платежей (за исключением таможенных сборов), взимаемых при таможенном оформлении товаров.
Режим Особой экономической зоны имеет для региона важнейшее значение. Он служит фундаментом для развития внешнеэкономического сотрудничества, привлечения инвестиций.
В январе 2009 г. была принята Областная целевая программа "Развитие внешнеэкономической деятельности и экспортного потенциала Магаданской области на 2009-2011 годы" [79]. Целями программы являются интеграция региона в систему международного разделения труда и развитие внешнеэкономических связей для оживления экономики региона. В качестве индикаторов программы приняты следующие показатели:
- увеличение внешнеторгового оборота Магаданской области до 350 млн долл.;
- увеличение объема поступления иностранных инвестиций до 30 млн долл. Программой предусмотрены перечень мероприятий и финансирование в объеме 17,39 млн рублей для достижения намеченных целей и задач.