В 2006 г. систематические наблюдения за качеством атмосферного воздуха велись Государственным учреждением "Колымское межрегиональное территориальное управление по гидрометеорологии и мониторингу окружающей природной среды по Магаданской области" только в г. Магадане за счет средств федерального бюджета на трех стационарных постах.
В воздухе контролировалось содержание основных загрязняющих веществ (взвешенных веществ, диоксидов серы и азота, оксида азота и оксида углерода) и специфических веществ (фенола, формальдегида), тяжелых металлов (свинца, железа, марганца, меди, никеля, хрома, цинка) и бенз(а)пирена.
Доминирующими загрязняющими веществами являются оксиды азота, фенол, формальдегид, бенз(а)пирен. Так, среднегодовые концентрации оксидов азота были на уровне 1 ПДК, фенола - 2 ПДК, формальдегида - 5 ПДК, бенз(а)пирена - 4 ПДК. Средние за год содержания взвешенных веществ, диоксида серы, оксида углерода не превышали предельно допустимых концентраций.
Средние за год содержания железа, марганца, свинца и цинка были выше средних концентраций по городам России и составляли 52; 0,44; 0,051 и 0,27 мкг/кв. м, соответственно. Случаев экстремально высокого загрязнения атмосферного воздуха не наблюдалось. Не отмечено и аварийных ситуаций, повлекших загрязнение атмосферы.
По сравнению с 2005 г., качество воздуха в областном центре не изменилось, но уровень его загрязнения остается высоким.