На территории Магаданской области речные перевозки осуществляются в среднем течении р. Колымы от пристани с. Колымское. Грузовые перевозки ведутся до пристани Зырянка (Республика Саха (Якутия)).
Положениями "Стратегии социально-экономического развития Дальнего Востока, Республики Бурятия, Забайкальского края и Иркутской области на период до 2025 года" предусматривается первоочередное развитие и техническое перевооружение с созданием терминальных логистических комплексов порта Зырянка. В перспективе намечено строительство устьевых перегрузочных комплексов в устьях реки Колымы. Данные мероприятия создадут условия для интенсификации судоходства и грузоперевозок по р. Колыме, позволят организовать грузоперевалку для использования возможностей Северного морского пути. Для Магаданской области это создаст новые возможности для речного сообщения не только с соседним регионом - Республикой Саха (Якутия), - но и с портами Севера России и Америки.
С ростом грузооборота в направлении Сеймчан - Зырянка - Севморпуть потребуется расширение речного терминала на пристани с. Колымское. Может возникнуть необходимость в формировании собственного речного флота Магаданской области.