Главный потенциал развития Магаданской области - богатейшие запасы минерально-сырьевых ресурсов. В недрах Магаданской области - 11% рудного и 15% россыпного золота. Общие разведанные запасы золота в Магаданской области превышают 6000 т.
Подавляющая часть запасов относится к коренному золоту и расположена в границах Магаданской части Яно-Колымской золоторудной провинции, сходной по многим параметрам с действующим сегодня золоторудным регионом в штате Невада (США), в котором ежегодная добыча составляет 200 т, запасы - 2 500 т и ресурсы - порядка 5 000 т золота. Наиболее крупные месторождения сосредоточены в так называемом Омчакском кластере. Крупнейшее среди них - Наталкинское месторождение, с запасами по категориям В + С1 + С2 в количестве 1836 т золота (40% от разведанных запасов всей провинции), из них эксплуатационные запасы составляют около 1500 т.
Магаданская область также - крупнейший источник серебра в России. По состоянию на 01.01.2008 балансовые запасы серебра по 18 месторождениям составляют по категориям В + С1 + С2 - 19407,2 тонн. По данным, приведенным в докладе Н.Н. Дудова, разведанные запасы серебра в области достигают 30 000 т. Прогнозные ресурсы серебра в области (включая предварительно апробированные) по 199 объектам, превышают 180 тысяч т. В целом, по сообщению президента РФ Д.А. Медведева на совещании в Хасыне 24.09.2008, в Магаданской области находится около половины всех ресурсов серебра России.
Помимо драгоценных Магаданская область располагает крупными ресурсами цветных и черных металлов:
- меди - прогнозные ресурсы составляют 17 млн т, это около пятой части российских ресурсов,
- молибдена - прогнозные ресурсы около 500 тыс. т,
- олова - балансовые запасы 14,8 тысяч т,
- свинца - балансовые запасы 67 тыс. т, прогнозные ресурсы 15 млн т,
- цинка - балансовые запасы 41 тыс. т, прогнозные ресурсы 40 млн т,
- железа - прогнозные ресурсы порядка 1 млрд т.
В области имеются значительные ресурсы углей, в том числе:
- каменный уголь (в основном категории D) - разведанные запасы по состоянию на 01.01.2008 176 млн т, прогнозные ресурсы около 4,7 млрд т,
- бурый уголь - разведанные запасы 375 млн т, прогнозные ресурсы около 30 млрд т,
- антрацит - разведанные запасы 28 млн т, прогнозные ресурсы около 6,2 млрд т.