В Ханты-Мансийском автономном округе - Югре насчитывается приблизительно 290 тыс. озер площадью более 1 га. Их общая площадь превышает 30 тыс. кв. км. Распределяются озера по территории очень неравномерно. Больше всего их сосредоточено в Среднем Приобье - 220 тыс. (3/4 их общего количества). При этом 93% расположено в правобережной части Ханты-Мансийского автономного округа - Югры, в том числе, в бассейне р. Тромъеган насчитывается до 90 тыс. озер, в бассейне р. Вах - 36 тысяч, в бассейне р. Лямин - свыше 30 тысяч, в бассейне р. Пим - 24 тысячи. Вместе с тем во всей левобережной части Среднего Приобья насчитывается примерно 17 тыс. озер. Много водоемов также в бассейне р. Конда (44 тыс.) и р. Казым (17,5 тысяч), но сравнительно мало их в Березовском и Советском районах.
Абсолютное большинство водоемов - это микроозерки, озерки и очень малые озера, их площадь менее 1,0 кв. км, почти все остальные - малые (от 1,0 до 10 кв. км). Водоемов с площадью более 10 кв. км, т.е. средних (до 100 кв. км) и больших (свыше 100 кв. км), насчитывается немногим более 200, из них 18 озер имеют площадь от 50 до 100 кв. км и только 4 (Кондинский Сор, Леушинский Туман, Вандмтор и Тормэмтор) являются большими.
По глубине подавляющее большинство озер относится к очень мелким (наибольшие глубины - менее 2 м) и мелким (от 2 до 5 м). Средняя глубина крупных внутриболотных водоемов колеблется в пределах 1,5 - 2,0 м, наибольшая обычно не превышает 2,5 м, редко достигая 4 - 5 м и более. Встречаются, однако, вблизи рек, особенно крупных, глубокие (от 10 до 20 м) и даже очень глубокие (более 20 м) водоемы. Среди последних наиболее известны такие озера, как Кинтус (48 м), Сырковый Сор (42 м), Чагорово (35 м), а также оз. Вырастоу в нижнем течении р. Аган (25 м), оз. Восточное вблизи г. Урай (12,8 м) и ряд других, котловины которых унаследовали переуглубленные участки ложбин древнего стока. Крупные, средние и многие малые внутриболотные озера (Тормэмтор, Вандмтор, Пильтанлор, Сырковое и др. с площадью более 1 - 2 кв. км) имеют, как правило, торфяные обрывистые берега высотой 1,5 - 2,0 м либо низкие (сплавинные) высотой 0,2 - 0,5 м.
Дно крупных водоемов обычно ровное, с малозаметным понижением к центральной части, сложено в основном минеральными грунтами (пески, супеси, суглинки). Песчаное дно характерно для внутриболотных озер бассейна рр. Назым, Лямин, Пим, Тромьеган, песчано-илистое - для озер бассейна р. Конды, суглинистое с торфяными отложениями - для озер бассейна рр. Вах, Ватинский Еган, Юган, Салым. Вблизи разрушаемых берегов озерное дно покрыто слоем размытого торфа. Самые малые озера, в основном, находятся в составе грядово-озеркового или грядово-мочажинно-озеркового комплексных микроландшафтов. Берега их, как правило, торфяные, низкие (0,2 - 0,5 м над уровнем воды), нередко сплавинные, дно обычно торфяное, чаще всего ровное со слабым понижением к центру. Мощность донных торфяных отложений колеблется от 5 - 10 см до 5 - 6 м. Множество таких водоемов образуют обширные болотно-озерные системы Сургутского полесья, левобережья бассейна р. Конда.
Озера нередко связаны между собой ручьями и протоками, образуя сложную по строению озерно-речную сеть. Большинство озер Ханты-Мансийского автономного округа - Югры не имеет поверхностного стока, т.е. они бессточные. В основном это водоемы площадью менее 1,0 кв. км. На долю сточных (они дают начало водотоку), проточных (через них протекает река) и озер с перемежающимся стоком (это в основном старицы), когда вытекающий водоток действует только в период стояния высоких уровней в водоеме, приходится всего 10 - 12%. Сточные и проточные озера - это, как правило, средние и большие водоемы, поэтому, несмотря на относительно малое их количество, они занимают до 50% и более площади всех внутриболотных озер той или иной озерной группы.
Заметно различаются озера по режиму - гидрологическому, гидрохимическому и гидробиологическому. Так, в годовом ходе уровня малых внутриболотных озер, обычно не имеющих руслового стока (притока), наблюдается два максимума и два минимума, а на средних и крупных внутриболотных озерах, имеющих, как правило, русловой сток, прослеживается лишь один максимум (весной) и один минимум (зимой). Крупные водоемы замерзают осенью и окончательно очищаются ото льда весной на несколько дней позже, чем малые озера. Толщина льда на крупных и средних водоемах больше, чем на малых. Крупные озера замерзают и очищаются ото льда на несколько дней позже, чем малые, и толщина льда на них больше на 15 - 35 см. В холодные зимы толщина льда достигает 150 - 170 см.
Химический состав воды достаточно разнообразен при преобладании ионов натрия, кальция и гидрокарбонатов. Общая минерализация озерных вод очень мала - от 10 - 15 до 50 - 70 мг/л, в среднем 20 - 25 мг/л. Все озера Ханты-Мансийского автономного округа - Югры пресные и ультрапресные, содержат много растворенных органических (гуминовых) веществ (кроме крупных водоемов), мало биогенных элементов, для них характерны кислая реакция среды (средняя величина pH колеблется от 4,5 до 6,5) и пониженное содержание кислорода. Дефицит кислорода приводит к летним и зимним заморам рыб, гибели беспозвоночных.
Разнообразен растительный и животный мир водоемов. Водные растения при фотосинтезе выделяют кислород и создают автохтонно (местное) органическое вещество. На дне водоемов из минеральных и органических частиц, приносимых стоком с водосборов (и ветром) и образующихся в самих озерах при разрушении берегов и отмирании растений и животных, образуются донные отложения.