При обосновании эффективности мероприятий Программы определялась коммерческая, бюджетная и социальная (общественная) эффективность.
Для оценки экономической эффективности мероприятий Программы в расчетах использованы ежегодные потоки чистого дохода и срок окупаемости инвестиций.
Затраты на мероприятия по реализации Программы путем повышения продуктивности орошаемых земель и прироста сельскохозяйственной продукции окупаются за счет чистой прибыли к середине 2035 года.
Чистый экономический эффект от прироста производства за период 2012-2020 годов составит 12658 млн. рублей.
Экономический эффект за весь инвестиционный срок проекта (40 лет) составит 93 млрд. рублей, то есть за срок амортизации оросительных систем вложенные в мелиорацию капитальные вложения окупаются в 2 раза. При этом бюджет получит в виде налогов и других платежей не менее 5,6 млрд. рублей.
Экологическая эффективность реализации мероприятий Программы проявляется как результат восстановления и сохранения плодородия почв на площади 209 тыс. гектаров сельскохозяйственных угодий.
Социальная эффективность Программы обеспечивается путем сохранения существующих и создания 35385 новых рабочих мест, повышения водообеспеченности сельских поселений, а также путем защиты от подтопления сельских населенных пунктов.
Выполнение мероприятий Программы будет способствовать развитию не только агропромышленного комплекса республики, но и других отраслей экономики.