Механизм реализации Программы базируется на принципах социального партнерства сельского населения, органов исполнительной власти Республики Дагестан, органов местного самоуправления, хозяйствующих субъектов и общественных организаций, а также четкого разграничения полномочий и ответственности всех участников Программы.
В выполнении Программы участвуют органы и учреждения, подведомственные Комитету по ветеринарии Республики Дагестан, Министерству здравоохранения Республики Дагестан, Управлению Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Республике Дагестан, а также государственное научное учреждение "Прикаспийский зональный научно-исследовательский ветеринарный институт" Российской академии сельскохозяйственных наук, федеральное казенное учреждение здравоохранения "Дагестанская противочумная станция", органы местного самоуправления.
В целях реализации Программы предусматривается создание координационного совета и рабочей группы, которые будут обеспечивать контроль за выполнением Программы и при необходимости вносить предложения в Правительство Республики Дагестан по ее корректировке.
Контроль за реализацией Программы осуществляет Правительство Республики Дагестан.