Основные направления финансирования Программы определены в соответствии с ее мероприятиями и включают в себя:
укрепление материально-технической базы учреждений здравоохранения;
совершенствование организации работы по оказанию медицинской помощи матерям и детям;
совершенствование системы кадрового обеспечения, подготовки и переподготовки медицинских кадров;
реализацию мероприятий республиканских целевых программ в сфере здравоохранения.